Genomiskā bibliotēka salīdzinājumā ar cDNA bibliotēku

Autors: Laura McKinney
Radīšanas Datums: 6 Aprīlis 2021
Atjaunināšanas Datums: 12 Maijs 2024
Anonim
Pushing the boundaries in legume breeding
Video: Pushing the boundaries in legume breeding

Saturs

Gan genoma bibliotēka, gan cDNS bibliotēka tiek izmantoti gēnu klonēšanā, lai izolētu dažādas DNS. Atšķirība starp abām šīm bibliotēkām ir tā, ka genoma bibliotēkā ir DNS fragmenti, kas izsaka visu organisma genomu, kamēr cDNS bibliotēkā mRNS tiek ņemts no konkrētām organisma šūnām, un tad cDNS veido šo mRNS reakcijā, kas tiek katalizēta. ar enzīmu.


Saturs: Atšķirība starp genomu bibliotēku un cDNA bibliotēku

  • Salīdzināšanas tabula
  • Kas ir genoma bibliotēka?
  • Kas ir cDNA bibliotēka?
  • Galvenās atšķirības

Salīdzināšanas tabula

PamatsGenomu bibliotēkacDNA bibliotēka
DefinīcijaGenoma bibliotēka ir pilnīga viena organisma genoma DNS kolekcija. DNS tiek glabāta līdzīgu vektoru populācijā, no kuriem katrs satur atšķirīgu DNS ieliktni.CDNS bibliotēka ir klonētu cDNS fragmentu maisījums, kas ievietots saimnieka šūnu atlasē, kas kopā veido kādu organisma transkripta daļu.
IzteiksmeViss genomsTikai specifiski gēni.
IzmērsLielāksMazāks
IntronsPašreizējaisNav
VektorsLielu fragmentu izvietošanai tas izmanto plazmīdas, kosmīdu, lambda fāgu, YAC un BAC.Tas nav introns, tāpēc pieticīgo fragmentu izvietošanai izmanto plazmīdas, fagemidīdus un lambda fāgus.

Kas ir genoma bibliotēka?

Gēnu klonēšanas procedūrā interesējošais gēns tiek kopēts no DNS, kas atdalīts no organisma. Kad DNS tiek atdalīts no organisma, tā gēni ir ekstrahēti vienā reizē. Organisma DNS satur tūkstošiem dažādu gēnu. Gēnu inženieris atrod vienu specifisku gēnu, kas kodē konkrēto interesējošo olbaltumvielu.


Absolūti nav vienas metodes, ar kuras palīdzību ir pieejams noteikts gēns no DNS, tāpēc zinātnieki veido gēnu bibliotēkas, lai kataloģizētu organisma DNS. Zinātnieki pēc tam atlasiet vēlamo gēnu bibliotēkā. Gēnu bibliotēka ir dzīvo baktēriju koloniju grupa, kas organismā ir pārveidota ar unikāliem DNS gabaliem, kas ir vēlamā gēna izcelsme. DNS iegūst no organisma, lai izveidotu bibliotēku, kas ir organizēta DNS forma. Genomu bibliotēka un cDNS ir divu veidu gēnu bibliotēkas. Rekombinantā tehnoloģijā kā gēnu stratēģijas ir izmantotas daudzas gēnu klonēšanas metodes.

DNS fragmenti tiek atdalīti, sagriežot ar īpašiem restrikcijas fermentiem no sākotnējās DNS. Šie fragmenti tiek savienoti ar vektora molekulām, un uzkrātās molekulas tiek pārvietotas saimnieka šūnās, pa 1 molekulā katrā šūnā. Genomisko bibliotēku veido introni, nevēlamā DNS un virkne citu fragmentu. Šajā bibliotēkā DNS tiek sadalīta mazākos fragmentos šūnas iekšpusē. Pēc tam visas mazās detaļas tiek ievietotas vektorā, lai izveidotu bibliotēku. Genoma bibliotēka satur visu gēnu DNS, un šūna satur visus to intronus. Genoma DNS ir visa genoma tulkojums. Intronu lieluma dēļ tajā nav kodēta viena kodona visa daļa. Genoma bibliotēkā nav neviena savienošanas mehānisma, kas sagādā grūtības no šīs bibliotēkas iegūto gēnu ekspresijā.


Kas ir cDNA bibliotēka?

cDNS bibliotēka tiek veidota, izvēloties vienu audu vai šūnu tipu. Pēc tam no šiem audiem vai šūnām izdala mRNS. MRNS molekulas DNS kopija sastāv no specifiska enzīma reversās transkriptāzes enzīma. Tātad cDNA bibliotēka satur šo specifisko DNS, kas atrodas mRNS. Šajā bibliotēkā nav atrasts introns un DNS secība. Šajā bibliotēkā visi kloni ir pilna garuma. Turklāt cDNS klons ir būtisks, lai transfektētu šūnas olbaltumvielu ražošanai vai šūnu analīzes veikšanai.

Galvenās atšķirības

  1. Genoma bibliotēka tika tieši uzrakstīta no genoma DNS.
  2. cDNA bibliotēka tika izveidota, izmantojot mRNA kā veidni.
  3. Genoma bibliotēka aizņem visu šī organisma genomu.
  4. cDNS bibliotēka attēlo tikai noteiktu kaites gēnus.
  5. Divi fermenti, restrikcijas endonukleāzes un ligāzes ir svarīgi genoma bibliotēkas veidošanai.
  6. Reversās transkriptāzes enzīmam ir nozīmīga loma cDNS bibliotēkas veidošanā.
  7. Genoma bibliotēka aizņem gan prokariotu, gan eikariotu organismu DNS.
  8. cDNS bibliotēka attēlo tikai eikariotu organismu DNS.
  9. cDNS bibliotēka spēj genoma ekspresiju prokariotu baktērijās, jo tām trūkst intronu.
  10. Par genomisko bibliotēku prokariotu organismā nevar pateikt, jo viņiem ir introni un prokariotu organismam nav iekārtu, kas apstrādātu intronus.